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晶体口袋约束下的小分子对接复核
图摘要
摘要
依据晶体配体或已知口袋限定搜索空间,并复核候选构象的几何匹配和关键接触。图摘要集中展示代表构象、关键接触与组间比较,使不同互作模式的特征能够快速对应。多维结果共同形成构象优先级与可继续研究的相互作用线索。
计算结果
结果
图1、基于对接获得的配体-蛋白结合模式;(A-B)小分子蛋白的3D作用模式,绿色虚线表示氢键作用。(C)小分子-蛋白的2D作用模式。绿色虚线表示氢键作用,粉色虚线表示Pi-Alkyl作用(疏水作用)。
该图呈现“结果”中的主要结构与趋势,并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
HS-CASE-0046
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