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当前显示 90 / 90 项科研服务
AI 药物设计
把表征学习、性质预测与物理筛选组织成可审查的候选优先级流程。
AI 药物靶点发现
整合遗传学、多组学、文献与知识图谱证据,为疾病相关靶点建立可追溯的优先级和验证假设。
基于结构的药物设计
从靶点结构、口袋状态和相互作用假设出发,组合热点识别、片段生长、构象筛选与先导优化。
配体设计、药效团与 QSAR
在结构信息有限时,以活性配体、分子描述符和适用域为核心建立可解释的化学空间模型。
ADMET 与计算毒理
整合结构警示、性质模型、相似化合物与网络证据,对吸收、分布、代谢、排泄和毒性风险做分层判断。
虚拟筛选
从化学库质控、分层筛选到人工复核,建立可回溯的命中发现路径。
小分子-蛋白对接
围绕蛋白口袋、配体微观状态和构象采样,评估小分子的可能结合姿势与关键相互作用。
多肽-蛋白对接
以多肽构象集合、受体界面和可用约束为输入,探索高柔性多肽的可能结合模式。
蛋白-蛋白对接
结合整体或局部搜索、构象集合与界面证据,提出蛋白复合物的可检验装配假设。
抗原-抗体对接
围绕抗体 CDR 构象、抗原表位和实验线索,构建候选抗原-抗体识别模式。
核酸-蛋白对接
显式考虑 DNA/RNA 构象、电荷和已知识别位点,探索核酸与蛋白的候选复合物界面。
金属-蛋白对接
结合金属价态、配位几何、蛋白质子化和位点证据,评估候选金属结合模式。
全柔性对接
同时扩展配体和受体侧链/骨架采样,用于可能存在诱导契合或多构象识别的体系。
共价对接
围绕反应基团、蛋白亲核残基和非共价预结合构象,构建反应感知的共价复合物假设。
分子动力学模拟
通过时间演化采样评估构象稳定性、相互作用占有率与可能的机制路径。
自由能计算
根据体系相似性、预算与精度目标选择端点法、绝对或相对自由能策略。
蛋白质设计
连接序列生成、结构筛选、界面评估和实验优先级,支持可追溯的设计迭代。
抗体建模与计算设计
围绕 Fv 结构、CDR 构象、抗原表位和可开发性建立抗体候选的计算评估路径。
蛋白互作与界面分析
组合复合物结构预测、对接、界面热点和动力学复核,研究蛋白—蛋白识别与调控机制。
多肽与环肽设计
围绕靶点界面、构象约束与可开发性设计多肽候选并建立筛选漏斗。
生物信息学与多组学
从研究设计和质控出发,连接统计检验、通路网络与生物学解释。
单细胞与空间组学
从样本和测序质控出发,解析细胞群、状态轨迹、空间邻域与组织微环境中的统计关联。
AI 生物信息学
以任务适配、基线比较和不确定性评估使用生物学基础模型与机器学习。
AI 虚拟细胞与扰动预测
用单细胞与多组学表征开展基因或药物扰动的情景模拟,为实验生成优先级和可检验假设。
自组装与超分子模拟
从分子单元、尺度选择和初始条件出发研究聚集、形貌演化与稳定机制。
计算化学
以明确的理论层级研究分子构象、非共价作用、光谱与反应趋势。
量子化学与反应机理
围绕过渡态、能垒和电子重排建立可复核的反应机理假设。
蛋白结构建模与精修
从序列、模板与实验约束出发建立结构模型,并系统评估局部几何、置信度和可用边界。
膜蛋白与生物膜体系建模
构建包含脂质、离子、配体与糖基化信息的膜环境,研究膜蛋白构象和界面相互作用。
增强采样与构象自由能
针对高能垒和稀有构象选择适当集体变量与采样策略,比较状态转变和相对自由能。
材料计算与候选筛选
组合电子结构、原子模拟与数据驱动筛选,研究催化、电池、吸附和功能材料候选。
基因组与转录组分析
围绕变异、表达和调控问题建立从原始数据质控到统计解释与外部验证的完整分析路径。
蛋白组、代谢组与脂质组分析
从峰表和鉴定证据出发,处理批次、缺失与注释不确定性,连接分子变化、通路和表型。
网络药理与靶点机制分析
整合化合物、靶点、疾病和通路证据,形成可追溯的多靶点机制假设与实验优先级。
反向靶点筛选
从匿名小分子出发,组合口袋表示检索、结构准备、批量对接与功能证据,缩小潜在靶点验证空间。
竞争性结合模拟
在匹配条件下比较无竞争与有竞争体系的界面接触、构象状态和近似能量趋势,形成可检验的竞争机制假设。
电子结构与分子性质
在明确电荷、质子化、构象与溶剂模型后,分析静电势、前线轨道和相对分子描述符。
非共价弱相互作用分析
组合 IGM、接触几何与必要的电子密度描述,定位氢键、色散和位阻区域并比较相对作用模式。
多组分混合物与相行为模拟
在显式环境中跟踪多组分体系的团簇、界面与聚集动力学,识别有限尺度下的相行为趋势。
定制科研计算平台
把数据、模型、计算任务、权限和报告组织成可部署、可审计的内部科研系统。
药效团建模
从活性配体或复合物结构提取必要相互作用特征,用于化学空间检索、活性模式解释与候选优先级。
片段药物设计
围绕口袋热点和片段结合姿势开展片段筛选、连接、生长与骨架替换,形成可合成的扩展方案。
PROTAC 设计与评估
联合靶蛋白配体、E3 配体、连接臂和三元复合物构象,比较降解分子设计中的几何与可开发性约束。
PROTAC Linker 设计与优化
对连接臂长度、柔性、出口矢量和理化性质进行构象采样,缩小可合成的 linker 设计空间。
分子胶设计
围绕诱导蛋白界面、配体结合位点与新生接触网络,比较可能稳定目标复合物的小分子设计。
药物重定位
整合疾病机制、药物靶点、转录响应、结构匹配与安全性信息,建立可追溯的重定位候选优先级。
共价药物虚拟筛选
将反应基团过滤、亲核残基几何、非共价预组织和共价对接结合,用于共价候选分层。
多靶点虚拟筛选
在多个主靶点、同源蛋白或抗靶点之间比较候选结合模式,支持多靶点设计与选择性风险排序。
化合物库设计与数据库挖掘
按化学质量、骨架多样性、性质窗口、可采购性和项目假设构建适合筛选的候选集合。
PBPK 与药代动力学建模
以物种生理参数、化合物性质和体外/体内数据构建研究型药代模型,比较暴露情景与参数敏感性。
分子对接与 SAR 解释
把同系化合物的活性变化与候选结合姿势、取代基方向和局部环境对照,形成可检验的构效解释。
残基相互作用与热点分析
综合界面几何、接触占有率、能量分解与保守性信息,定位可能影响结合或识别的关键区域。
AlphaFold 模型对接适用性评估
检查预测结构的局部置信度、口袋几何、构象状态和模板支持,判断哪些区域可用于后续对接。
小分子–DNA/RNA 对接
显式考虑核酸构象、电荷、沟槽和碱基堆积,探索小分子与 DNA 或 RNA 的候选识别模式。
糖类–蛋白对接
考虑糖环构象、糖苷键自由度和羟基网络,比较寡糖、糖链或糖模拟物的候选结合模式。
酶–小分子互作建模
围绕催化构象、底物通道、辅因子和质子化状态,比较底物、抑制剂或调节剂的候选识别方式。
全原子分子动力学
以原子分辨率跟踪生物分子、配体、溶剂和离子的构象演化,分析可重复的结构与相互作用趋势。
粗粒化分子动力学
通过降低体系自由度扩大可模拟尺度,用于膜、自组装、聚合物和大型复合体系的结构趋势研究。
伞形采样与 PMF
沿预先定义的反应坐标布置重叠窗口,重建相对平均力势并检查窗口覆盖和收敛。
引导分子动力学
通过受控外力沿指定方向推动体系,用于比较解离路径、机械响应和后续自由能采样区间。
复制交换分子动力学
通过温度或哈密顿量维度的多副本交换扩展构象采样,适用于肽、折叠单元和多稳态体系。
靶向分子动力学
在已知起始和目标结构之间施加渐进约束,生成候选转变路径并定位可能的结构瓶颈。
抗体分子动力学
围绕 CDR、框架区、抗原界面和可选糖基化状态,比较抗体构象稳定性与局部柔性。
抗体人源化设计
通过胚系框架选择、CDR 移植、回突变和结构复核,提出保留识别几何的人源化候选序列。
抗体亲和力成熟
结合界面热点、序列约束、突变枚举和结构复核,缩小抗体亲和力优化的实验突变空间。
双特异性抗体设计
围绕两种识别臂、分子架构、链配对和空间可达性,比较双特异性抗体的候选构型。
单域抗体与纳米抗体设计
针对单域抗体的框架、长 CDR3、溶解性和表位可达性,开展结构建模与序列优化。
酶设计与优化
围绕催化几何、底物通道、稳定性和序列约束,提出可验证的酶突变和底物选择性设计。
蛋白疫苗计算设计
整合抗原序列、结构暴露、表位预测、保守性和人群覆盖信息,形成实验候选构建设计。
多肽库设计
按序列多样性、界面热点、理化性质、修饰和合成约束构建规模可控的候选多肽库。
环肽构象建模
针对头尾环化、侧链桥联和非天然修饰,生成环肽构象集合并比较预组织程度与靶标适配。
表观组学分析
围绕染色质开放、组蛋白修饰、DNA 甲基化和调控元件,解析条件相关的表观调控变化。
mRNA 表达分析
从原始 RNA 测序或表达矩阵出发,完成质控、定量、差异表达、剪接与功能解释。
microRNA 分析
解析小 RNA 表达、差异 microRNA、候选靶基因和调控通路,并与 mRNA 或表型证据交叉验证。
微生物组与宏基因组分析
从扩增子或宏基因组数据评估群落组成、功能潜力、差异特征及其与宿主表型的关联。
生物标志物与靶点识别
整合表型、组学、遗传学和外部证据,区分预测性能、机制关联和干预可行性三个层面的候选。
生存分析
围绕事件定义、随访、删失和协变量构建科研型时间结局分析,报告效应、假设检查和不确定性。
科研临床数据分析
对去标识化研究数据开展数据字典整理、描述统计、关联模型和敏感性分析,服务于科研问题而非诊疗决策。
基因共表达网络分析
从表达矩阵识别协同变化模块,将模块与表型、细胞状态和功能通路关联。
基因调控网络分析
结合表达、调控元件、转录因子基序和可选扰动数据,推断条件相关的候选调控关系。
构象搜索与几何优化
通过分层构象搜索和量子化学优化建立低能构象集合,为光谱、反应和分子性质计算提供可靠起点。
过渡态与反应路径计算
搜索候选过渡态并通过频率和反应路径连接验证,比较可能机理的相对能垒与结构依据。
QM/MM 多尺度建模
以量子区描述成键、电子和金属中心,以分子力学环境保留蛋白或材料的结构约束。
计算光谱预测
依据低能构象和适当理论层级预测 IR、UV、NMR、ECD、VCD 或荧光特征,辅助谱峰与构象归属。
第一性原理材料计算
基于周期性电子结构计算比较晶体稳定、能带、态密度、表面与缺陷等材料性质趋势。
催化剂发现与反应机理
比较催化中心、吸附构型、中间体和候选反应路径,为催化剂组成与实验条件提供计算优先级。
电池材料与电解质设计
从电极结构、离子迁移、溶剂化和界面反应角度比较电池材料与电解质候选。
多孔吸附与分离材料
针对 MOF、COF、沸石或多孔聚合物,比较孔结构、吸附位点、容量与组分选择性趋势。
聚合物、涂层与胶黏剂配方
从链构象、组分相容、界面黏附和配方描述符比较聚合物、涂层与胶黏剂候选。
药物晶型、盐型与共晶设计
结合分子互补性、晶体结构、周期能量和性质风险,比较药物固态形式的候选优先级。